金税工程是国家电子政务“十二金”工程之一，是一个庞大的全国性的税收征管系统，具有重要的战略地位。金税三期表示金税工程已经经历了一期和二期，现在是三期。目前，各地方使用的税收征管系统并不统一，比如深圳，一直使用的是本地开发的CTAIS税收征管系统。
按照国家的指示，今年10月份，全国各地税务机关必须全部使用金三进行税收管理工作。为确保系统切换能够平稳过渡，深圳国税将在9月份试行双轨运转，也就是说同一份业务，税务局的人既要在CTAIS中录入也要在金三中录入，方便“比对差异、查找出入、解决问题”。
在2016年5月1日，中国完成了营改增的全覆盖，这意味着增值税实现了对我国所有企业经济活动的覆盖。而金税三期也于最近在各地税务机关完成全面上线，金税三期的全面上线使税务机关对纳税人的全面监控进入了一个新的时代，简单讲就是纳税人在税务机关面前变得更加透明了。纳税人几乎所有的经营行为都会被纳入税务机关的监控范围，因而涉税风险会大大提高。
